調べたところ
ECCUBE2.0とかであると/ec-cube/config/config.phpを以下のように編集しなければならないようです。
ただ、config.phpは3.0にはみあたらなく。config.ymlのところにも同じように設定できるような項目がありませんでした。
どなたかご教授お願いします。

編集前 define ('HTTP_URL', 'http://kir000000.kir.jp/ec-cube/');
define ('HTTPS_URL', 'http://kir000000.kir.jp/ec-cube/');
define ('ROOT_URLPATH', '/ec-cube/');
編集後 define ('HTTP_URL', 'http://www.example.com/');
define ('HTTPS_URL', 'http://www.example.com/');
define ('ROOT_URLPATH', '/');