商品登録CSVでの登録で、約5000件の商品情報をCSVでアップロードすると、
｢システムエラーが発生しました。大変お手数ですが、サイト管理者までご連絡ください。｣
と表示され登録できません。
商品数を100件程度にすれば登録できるのですが、商品数が増えれば同じエラーが発生します。
これはサーバー側の設定の問題でしょうか？

何とぞよろしくお願いいたします。

デバッグ結果です。
▼▼▼ エラーメッセージ ▼▼▼
https://***.***..***..***./main/admin/products/upload_csv.php?

USER_AGENT: Mozilla/5.0 (Windows NT 6.1; WOW64) AppleWebKit/536.5 (KHTML, like Gecko) Chrome/19.0.1084.56 Safari/536.5

SQL: SELECT COUNT(*) FROM dtb_category WHERE category_id IN (?)

MDB2 Error: unknown error

_doQuery: [Error message: Could not execute statement]
[Last executed query: PREPARE mdb2_statement_mysql_23347030d2507968e99040471a7090d9a6c0dcfa339 FROM 'SELECT COUNT(*) FROM dtb_category WHERE category_id IN (?)']
[Native code: 1461]
[Native message: Can't create more than max_prepared_stmt_count statements (current value: 16382)]


/opt/apache_2.2.22/htdocs/main/admin/products/upload_csv.php 34:LC_Page_Admin_Products_UploadCSV_Ex->process
/opt/apache_2.2.22/data/class_extends/page_extends/admin/products/LC_Page_Admin_Products_UploadCSV_Ex.php 56:LC_Page_Admin_Products_UploadCSV->process
/opt/apache_2.2.22/data/class/pages/admin/products/LC_Page_Admin_Products_UploadCSV.php 90:LC_Page_Admin_Products_UploadCSV->action
/opt/apache_2.2.22/data/class/pages/admin/products/LC_Page_Admin_Products_UploadCSV.php 129:LC_Page_Admin_Products_UploadCSV->doUploadCsv
/opt/apache_2.2.22/data/class/pages/admin/products/LC_Page_Admin_Products_UploadCSV.php 234:LC_Page_Admin_Products_UploadCSV->lfCheckError
/opt/apache_2.2.22/data/class/pages/admin/products/LC_Page_Admin_Products_UploadCSV.php 351:LC_Page_Admin_Products_UploadCSV->lfCheckErrorDetail
/opt/apache_2.2.22/data/class/pages/admin/products/LC_Page_Admin_Products_UploadCSV.php 663:LC_Page_Admin_Products_UploadCSV->lfIsDbRecordMulti
/opt/apache_2.2.22/data/class/pages/admin/products/LC_Page_Admin_Products_UploadCSV.php 790:SC_Query->count
/opt/apache_2.2.22/data/class/SC_Query.php 135:SC_Query->getOne
/opt/apache_2.2.22/data/class/SC_Query.php 601:SC_Query->prepare
/opt/apache_2.2.22/data/class/SC_Query.php 873:MDB2_Driver_mysql->prepare
/opt/apache_2.2.22/data/module/MDB2/Driver/mysql.php 1123:MDB2_Driver_mysql->_doQuery
/opt/apache_2.2.22/data/module/MDB2/Driver/mysql.php 798:MDB2_Driver_Common->raiseError
/opt/apache_2.2.22/data/module/MDB2.php 1497:PEAR->raiseError
/opt/apache_2.2.22/data/module/PEAR.php 557:MDB2_Error->MDB2_Error
/opt/apache_2.2.22/data/module/MDB2.php 1009:PEAR_Error->PEAR_Error
▲▲▲ エラーメッセージ ▲▲▲

Apache/2.2.22
PHP/5.2.17
MySQL 5.1.61
eccube2.11.5

たしか、MySQL の脆弱対策の影響だったと思います。

MySQL の設定で変更できたと思います。実行権限にもよるかもしれませんが、動的な変更も可能だったと記憶しています。

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Seasoft
こちらでの投稿は、アイディア程度に留めさせていただいております。
個別案件の作業は有償で承っております。お気軽にご相談ください。

有難うございます。

mysqlの設定はほとんどをデフォルテのままです。
実行権限はrootで持っています。

mysql設定のどの値が影響しているんでしょうか？引用：

max_prepared_stmt_count だと思います。

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Seasoft
こちらでの投稿は、アイディア程度に留めさせていただいております。
個別案件の作業は有償で承っております。お気軽にご相談ください。

max_prepared_stmt_countの値を変更したところ
エラーがでることなくCSVをアップできるようになりました。

有難うございました！
助かりましたｍ（＿　＿）ｍ

追記
その後、PHPでのタイムアウトが発生し
php.iniのmax_execution_timeを一時的に増やしました。
アップロード後、値をデフォルトに戻しました。