2.12.4を使っています。

管理画面だけに新しい支払方法を追加（表示）する事はできますか。
できる場合、どこを編集すれば良いのでしょうか。
ファイルを直接修正しなくてはいけない場合、
どのファイルのどこと教えて頂ければ幸いです。
（プログラミングにはそこまで詳しくないので。。。）
法人の受注だけ、管理画面から、銀行振り込みを選択できるようにしたいです。

よろしくお願い致します。

はい。「基本情報管理＞支払方法設定」画面の [支払方法を新規入力] ボタンですね。

周辺の設定もありますので、運用前にざっと一通りの画面・機能を眺めておいたほうが良いと思いますよ。

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Seasoft
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seasoft様の補足になりますが、

支払い方法は配送管理にて、配送方法ごとに選択可能な支払い方法を選んで始めてフロントで確認できるようになります。

どの配送方法にも銀行振り込みをチェックしなければフロントでは表示されません。
受注ではマニュアルに選択可能です。

遅くなりましたがご返信ありがとうございました。
無事解決致しました。
簡単な事でしたね。。。マニュアル等もっと目を通そうと思います。