<script type="text/javascript">
// カテゴリーテーブルのイニシャライズ
$(document).ready(function() {
    $("#categoryTable").tableDnD({
        onDrop: function(table, row) {
            var rows = table.tBodies[0].rows;
            var keys = row.id;

            for (var i = 0; i < rows.length; i++) {
                if (row.id == rows[i].id) {
                    keys += "-" + i;
                    break;
                }
            }

            fnModeSubmit('moveByDnD','keySet', keys);
        }
    });
});
</script>

// テーブルをドラッグ＆ドロップした時の処理
case 'moveByDnD':
    // DnDしたカテゴリと移動先のセットを分解する
    $keys = explode("-", $_POST['keySet']);
    if ($keys[0] && $keys[1]) {
        $objQuery = new SC_Query();
        $objQuery->begin();
        
        // 移動したデータのrank、level、parent_category_idを取得
        $rank   = $objQuery->get("dtb_category", "rank", "category_id = ?", array($keys[0]));
        $level  = $objQuery->get("dtb_category", "level", "category_id = ?", array($keys[0]));
        $parent = $objQuery->get("dtb_category", "parent_category_id", "category_id = ?", array($keys[0]));

        // 同一level内のrank配列を作成
        $objQuery->setoption("ORDER BY rank DESC");
        if ($level == 1) {
            // 第1階層の時
            $arrRet = $objQuery->select("rank", "dtb_category", "level = ?", array($level));
        } else {
            // 第2階層以下の時
            $arrRet = $objQuery->select("rank", "dtb_category", "level = ? AND parent_category_id = ?", array($level, $parent));
        }
        for ($i = 0; $i < sizeof($arrRet); $i++) {
            $rankAry[$i + 1] = $arrRet[$i]['rank'];
        }

        // 移動したデータのグループ内データ数
        $my_count = $this->lfCountChilds($objQuery, "dtb_category", "parent_category_id", "category_id", $keys[0]);
        if ($rankAry[$keys[1]] > $rank) {
            // データが今の位置より上がった時
            $up_count = $rankAry[$keys[1]] - $rank;
            $decAry   = $objQuery->select("category_id", "dtb_category", "level = ? AND rank > ? AND rank <= ?", array($level, $rank, $rankAry[$keys[1]]));
            foreach($decAry as $value){
                // 上のグループから減算
                $this->lfDownRankChilds($objQuery, "dtb_category", "parent_category_id", "category_id", $value["category_id"], $my_count);
            }
            // 自分のグループに加算
            $this->lfUpRankChilds($objQuery, "dtb_category", "parent_category_id", "category_id", $keys[0], $up_count);
        } else if($rankAry[$keys[1]] < $rank) {
            // データが今の位置より下がった時
            $down_count = 0;
            $incAry     = $objQuery->select("category_id", "dtb_category", "level = ? AND rank < ? AND rank >= ?", array($level, $rank, $rankAry[$keys[1]]));
            foreach ($incAry as $value) {
                // 下のグループに加算
                $this->lfUpRankChilds($objQuery, "dtb_category", "parent_category_id", "category_id", $value["category_id"], $my_count);
                // 合計減算値
                $down_count += $this->lfCountChilds($objQuery, "dtb_category", "parent_category_id", "category_id", $value["category_id"]);
            }

            // 自分のグループから減算
            $this->lfDownRankChilds($objQuery, "dtb_category", "parent_category_id", "category_id", $keys[0], $down_count);
        }
        $objQuery->commit();
    }
break;

そういえば、動作的にはどちらでも同じだと思いますが、拡張は、
/data/class/pages/admin/products/LC_Page_Admin_Products_Category.php
ではなく
/data/class_extends/page_extends/admin/products/LC_Page_Admin_Products_Category_Ex.php
でやる設計思想のようなことをnanasessさんがどこかで
おっしゃられてた気がしました。

LC_Page_Admin_Products_Category_Ex.php

default:
    $this->arrForm['parent_category_id'] = 0;
    break;

}else if($rankAry[$keys[1]] < $rank){

.tDnD_whileDrag {
    background-color: #b7b7b7;
}