初めて書き込みさせていただきます。

EC-CUBEの決済・配送機能を削除したいのですが、可能でしょうか? 要は、WEBサイト上で商品を予約して、後日店頭で商品受取と代金支払をしたいのです。

詳細が分からないと見積りもできないと思いますが、そういったカスタマイズをお願いすると大体いくらぐらいになるのでしょうか。

宜しくお願いいたします。

特にカスタマイズする必要はなく、決済方法は「店鋪窓口でお支払い」、配送方法は「店鋪で受け渡し」とでも設定しておけば良いのでは？
あとは注文確認メールに、もう１度どの旨を記載しておけば良いと思います。

必要であれば、注文確認後の画面でもお支払いや受け渡しは店鋪でする旨を表示するように書き加えて置けば良いですね。

ありがとうございます!
店舗で支払いなど選べるのですね。
参考にさせて頂きます。