http://elleshop.jp/web/contents/top/
のようなものにカスタマイズしたいのですが、初心者ですが、ご指南頂けるやさしい方お願いいたします。
いろいろと検索ているのですがスライダー設置方法と、上記サイトのようにヘッダー付近にカテゴリーを置いてプルダウンできれば理想です。
よろしくお願いします

jQueryのスライダーで簡単に実装できそうなものが下記のページで紹介されていましたので、参考にしてみてください。
http://zxcvbnmnbvcxz.com/jquery-%E7%B0%A1%E5%8D%98%E3%81%8B%E3%81%A4%E9%AB%98%E6%80%A7%E8%83%BD%E3%81%AA%E3%82%B9%E3%83%A9%E3%82%A4%E3%83%80%E3%83%BC%E3%80%90bxslider%E3%80%91%E3%81%AE%E8%A8%AD%E7%BD%AE-div%E3%82%B9/

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具体的に設置方法をご指南下さい

EC-CUBEデフォルトのテンプレートをベースとすると仮定して回答します。

ヘッダのカテゴリプルダウン:
デザイン管理＞PC＞ヘッダー/フッター設定 にて、ヘッダを編集

メインエリアのスライダー:
デザイン管理＞PC＞ブロック設定　にて、スライダーエリア用のブロックを新規作成し、そのブロックを
デザイン管理＞PC＞レイアウト設定 のTOPページ　へ追加する

という方法で、管理できるかと思います。

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そのブロックがうまく設定できません・・・
すいませんがご教授お願いします。

うまくいかないというのは、「登録ボタン」を押しても新規ブロックが生成されていない状態でしょうか。または何かエラーの様なものが出てしまっている状態でしょうか？

そもそもの設置方法で迷われている様でしたら、下記のサイト様にてブロックの設定について詳しく書かれておりますので、参考にしていただければと思います。

http://www.tokihouse.com/ec-cube/block2.html