現在ECサイトをインストールしデフォルトの状態です

他のサイトでeccube bootstrapという無料のテンプレートを見つけましたがECCUBEをいじるのは初心者なのでまず最初にルートディレクトリーとはどこにあるのかがわかりません

基本がわかっていないようですどなたか教えていただけますか？

このテンプレートは下記のサイトを参照しました

http://blog.verygoodtown.com/2014/05/free-ec-cube-template-responsive/

手順も書かれているのですが

インストール

EC CUBEルートディレクトリーにコピーします。

$ git clone https://github.com/nagaki/eccube-bootstrap.git
$ cp -R eccube-bootstrap/* ~/path/to/eccube/
$ cp -R eccube-bootstrap/.* ~/path/to/eccube/ #gitファイルコピー

データベーステーブルdtb_templatesに値を追加します。

mysql> INSERT INTO dtb_templates VALUES ("bootstrap", 10, "bootstrap", now(), now());

管理画面メニュー デザイン管理>PC>テンプレート設定よりテンプレートを変更します。

スマートフォンテーマ

レスポンシブテーマなので、data/class/SC_Display.phpにあるスマートフォン判定のコードを削除することで使用できます。

// data/class/SC_Display.php:141
function detectDevice() {
$nu = new Net_UserAgent_Mobile();
$su = new SC_SmartphoneUserAgent_Ex(); //削除
if ($nu->isMobile()) {
return DEVICE_TYPE_MOBILE;
} elseif ($su->isSmartphone()) { //削除
return DEVICE_TYPE_SMARTPHONE; //削除
} else {
return DEVICE_TYPE_PC;
}
}

ここでまず
EC CUBEルートディレクトリーにコピーします。
がECのどこのファイルを見たら良いのかわかりません

ダウンロード、展開したeccubeフォルダ直下となります。
dataフォルダ,htmlフォルダ等が含まれる階層に eccube-bootstrapフォルダを設置するようです。