8400円以上で送料が無料の設定をしているにもかかわらず、
全てのお買いもので送料が無料ですと表示が出ますが、ちゃんと計算はされており、8400円以下の場合は送料が表示されています。

どこがおかしいのでしょうか？？？

EC-CUBEバージョン 2.4.3
PHPバージョン PHP 5.2.17
DBバージョン MySQL 5.0.51a-community-log

テンプレートの表記が間違っているということはありませんか？

計算はできているとのことですので、値はDBに入っており、テンプレートでのメッセージを表示させる分岐のところに問題があるのではないかと思います。

カート画面のテンプレートの送料表示の部分を確認してみてください。