ゲスト投稿になってしまったこと、まずはお詫びいたします。

上記の件につきまして、自己解決いたしました。

日本のサイトでは確認できませんでしたが、ほぼ同じような環境でGROUP BY および DISTINCTが使えないとの報告があがってました。

以下はその報告のひとつです。
linux.debian.bugs.dist

バージョンをあげようと思いましたがPostgresへDBを変更して運用テストさせていただいてます。

EC-CUBEバージョン 2.0.1
PHP 4.4.4-8+etch4
DB MySQL 5.0.32
OS Debian

おそらくSQLの問題なのでしょうか。

発行しているSQL(多少成形してます)
〜〜〜〜 SQL　〜〜〜〜〜〜〜〜〜
SELECT
COUNT(dtb_class.class_id),
dtb_class.class_id

FROM
dtb_class
INNER JOIN dtb_classcategory ON
dtb_class.class_id = dtb_classcategory.class_id

WHERE
dtb_class.del_flg = 0
AND
dtb_classcategory.del_flg = 0

GROUP BY dtb_class.class_id,dtb_class.name
〜〜〜〜〜〜〜〜〜〜〜〜〜〜〜〜〜〜〜〜〜〜〜〜〜

DBのエラー内容は
Lost connection to MySQL server during query
です。

SELECT
dtb_class.class_id

FROM
dtb_class
INNER JOIN dtb_classcategory ON
dtb_class.class_id = dtb_classcategory.class_id

上記のSQLを発行すればきちんと結果も返ってくるのでGROUP BY − COUNT　のあたりが怪しまれます。

MySQLのバグだと切り分けはできてると思うのですが解決方法がみつかりません。
ご指南いただけませんでしょうか