カスタマイズの一環で、削除フラグの立った商品規格をID直指定でゲットしたいのですが…

削除フラグが無いものの場合は、
例えばdtb_product_classテーブルのproduct_class_idが60の場合、
$app['eccube.repository.product_class']->find(60);
…で取る事ができます。
その後、この該当データのdel_flgを1にセットしたら同じコードでは取る事ができなくなります。
del_flgが1でも取る方法は無いでしょうか？

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あと、同じようなことをしているコードはないかと探してみると、
src\Eccube\Controller\Admin\Product\ProductClassController.php
の395行目あたりに

// デフォルトの商品規格を更新
$defaultProductClass = $app['eccube.repository.product_class']
->findOneBy(array('Product' => $Product, 'ClassCategory1' => null, 'ClassCategory2' => null, 'del_flg' => Constant::ENABLED));

…というコードがあったのでこれを実行してみたところ、
該当するデータがあるにも関わらず取れませんでした。

そこで、
$app['eccube.repository.product_class']->findOneBy(array('Product' => $Product));
に変更して、格納された全ての規格を確認すると、削除フラグの立ったものは全て除外されていました。