[EC-CUBE] 2.13.3
[レンタルサーバ] data-hotel.net
[OS] windows7
[PHP] 5.3.29 (Core, date, ereg, libxml, openssl, pcre, sqlite3, zlib, ctype, curl, dom, fileinfo, filter, gd, hash, iconv, json, mbstring, mysql, SPL, PDO, pdo_sqlite, session, posix, Reflection, standard, SimpleXML, soap, SQLite, Phar, tokenizer, xml, xmlreader, xmlwriter, apache2handler, mcrypt)
[データベース] MySQL 5.5.40
[ブラウザ]firefox,chrome

10月からネクストエンジンを取り入れ、
注文管理をしており最近お客様からクレームの連絡が何度か来ており
納期通りに商品発送しているためネクストエンジン上で調べると該当客の注文がヒットせずEC CUBE管理画面ではヒットする。
ネクストエンジンの注文の取り込み方法がメールベースのため管理者にメールが来ない場合はネクストエンジン内に取り込まれない
といったバグかと思います。

過去記事を確認すると

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[1] ECサイト管理ページにログインします

[2] メニューからシステム設定をクリックします

[3] パラメーターの設定でMAIL_BACKENDの設定値を下記のように修正します
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　[修正前]
　MAIL_BACKEND 　　"smtp"
　[修正後]
　MAIL_BACKEND 　　"mai"l
　------------------------------------
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とありますがそもそも2.13.3に
MAIL_BACKENDという項目がございません。

わりと深刻な問題でございますのでご教授頂けますと幸いでございます。