重複カテゴリーidの削除方法をおしえてください
昨年、カテゴリーが重複表示される件でcategory_idが何らかの原因で重複登録されるためにカテゴリーが複数表示される現象がありました。今回は動作環境が変わったため（サーバー移転）か？前回の対処では重複したcategory_idを削除できません。
前回のスレッドは既に解決済みになっていますので再質問させていただきます。

[EC-CUBE]2.11.5
[レンタルサーバー]ファーストサーバ,Zenlogic
[OS]Linux
[データベース]MySQL5.0.96
phpMyAdmin:4.0.10.6
[php]5.2.17p3
[WEBサーバ]Apache2.2

昨年karin様よりphpMyAdminでdtb_category_total_countの中で重複したcategory_idを検索し、複数個表示されるものを削除して1個にすれば解決するということを教示いただきました。その節は大変お世話になりました。それで問題は解決していました。
http://xoops.ec-cube.net/modules/newbb/viewtopic.php?topic_id=16598&forum=10&post_id=73395#forumpost73395

御蔭様でこの一年問題は起きませんでしたが、今回また同じ現象が起きました。
早速category_idを検索すると複数個同じものがあります。前回は検索結果から余分な1個を削除できた…と思います。ところが今回は表示はされるるものの削除ができません（削除操作ができない）。
原因はサーバーを変更（ファーストサーバ社内のコース変更）したためにphpMyAdminが新バージョンに変わった？ため操作ができなくなったためか？正直、何もわかりません。
DELETEを使うと重複も含めて全部消えてしまいます。（EC−Cubeの見本商品であるid=1　も重複していましたので試しにDELETEしてみました）。
現在のdtb_category_total_countテーブルを印刷してみると、表示設定をしていないidでも重複が起こっています（気が付かなかっただけです）。
phpMyAdminで重複分だけ削除して整理することはできないでしょうか。どなたか、教えていただけないでしょうか。