現在ファーストサーバでSSLを利用してECCUBEを導入しています。
それにあたり、カート画面に飛ぶところや、会員登録の完了画面がNot Foundになり表示されません。

■環境
サーバ：ファーストサーバ　ギガント２
ECCUBE：2.1.2
PHP　 ：5.2.6
MYSQL ：MySQL 5.0.27-standard

非SSL領域：/virtual/www/
　SSL領域：/virtual/ssl/
　CGI領域：/cgi-data/


■[現象箇所]カート画面
カートの中をみて、「購入手続きへ」を押すと以下のURLにアクセスし、Not Foundが表示されます。

https://[ドメイン]/virtual/ssl/shopping/deliv.php?=[変数]

原因はわかっていて、URLに【/virtual/ssl】があるからです。

これはサーバ内でのSSL領域の絶対パスで、なぜここでこのように挿入されるのかがわかりません。
（※もちろんsslディレクトリにソースは配置しており、上記絶対パス部分を削ればアクセスできます。）
原因がインストール時の設定なのか、サーバの設定なのか、もしくはソースを修正すべきなのか今のところ判別がつきません。

上記現象がSSLでアクセスするボタン（リンクではなく、inputタグ）のところで出ます。

非常に困っているのでアドバイスを頂けると幸いです。
よろしくお願い致します。