eccube v 2.4.1を利用していますが、
管理画面のカテゴリ編集画面で左ブロックに表示されている
カテゴリのツリー構造部分のソースを眺めると<div>タグが
閉じられていない気がします。

<!--{section name=cnt loop=$arrTree}-->....</section>
ループ終了後に<div>...</div>チェックが必要かと思います。
私は新規にカウンタを作って、<div>書き出し時にインクリメント、
</div>書き出し時にデクリメントして、ループ終了後のカウンタ値
分</div>を強制的に書き出す様に修正しました。

間違っていたらゴメンなさい。
また既に報告済み（対策済み）なら更にゴメンなさい。
＊フロント機能ではなく、管理機能でした。スイマセン。