結論からいうと、大河内様のUTF-8版を使用してエラーが出なくなりました。

utf8セッティングされたMySQLにujisでデータベースを作り、

Server characterset: utf8
Db characterset: ujis
Client characterset: utf8
Conn. characterset: utf8

という状態で SET NAMES binary を追記してテストを行っているとglib.phpの上記エラーがでるようになります。
MySQLから取り出したデータとphpスクリプトが混ざってしまって？エラーが出ていたようです（汗）。