お客様情報入力画面に戻ったところで, お届け先に紐付いた「お支払方法・お届け時間等指定」が初期化されるため, クリアされるのは仕様ですね...

2.11系から, 複数お届け先指定ができるようになったため, お客様情報入力画面に戻ったタイミングで, お届け先に紐付く情報を初期化しないと, データの不整合が発生してしまいます.

2.11系は, 残念ながら保守対象外ですので, 自力で解決するしかないと思います.
しかし, 複数お届け先指定機能を使用している場合は, 上記の理由から完全な解決は難しいかもしれません.