回答ありがとうございます。

＞ 参考までに、「商品管理＞商品登録CSV」は使用していますか?

こちらは使用していません。
商品は全て管理画面から手動で登録したものです。

関係あるかどうかはわかりませんが、
規格のうちの1商品は、公開時から在庫切れにしていたので、
・無制限
・無制限
・在庫切れ
・無制限
・無制限
という状態でした。

今回、もう1商品を在庫切れにしようと思い、規格を開くと
・無制限 -1
・無制限 -5
・在庫切れ
・無制限 -3
・無制限
という状態になっていました。

このうち、もう1商品を在庫切れにしようとした際に、
・無制限 -1　エラー表記
・無制限 -5　エラー表記
・在庫切れ
・在庫切れ
・無制限
という状態で、登録できなくなったという具合です。

もしバグなら対応を期待しますが…
よろしくお願いいたします。