お礼が遅くなり申し訳ありません。

システム的にAjaxリンクが無効になっているのならば、そもそもプリフェッチ機能なども使えないということなのでrel="external"を削除してもメリットは得られないかな？とも思っています。

いずれにせよ安定しないという理由があって殺している機能ならば、テストも大変なので無理して動かすのは辞めにします。

ご教授ありがとうございました。