スレッドを立てた者です。お返事有難うございます。

：mi-yan　様
　やはりそれが一番早い方法なのですね
　一応、文字列検索で.tplをピックアップしてはあります。

：plus5　様
　フロント機能に絞れば９ファイル程度でしょうか？　管理機能については「コスト優先！」という呪文で納得させるつもりです
　ただし、流石に全て半日ではちょっと厳しいですね。調査とロジック検討に半日、実作業に半日の、テストの立案と実行に１日弱というところでしょうか。
　ここは直接お客さんに見えるところですから、正直若干臆病になってしまいます。
　パッケージのカスタマイズは「ここだけ抑えておけば概ねOK」という見切りが難しいところが問題ですね。
　フラグのOn／Offは、Smartyの「config_load」あたりをお使いになられたのでしょうか？