商品点数2000〜3000点のECサイトを運営しております。

先日、運用をお願いしているWeb制作会社より、これ以上商品の登録（増加）、差し替え、削除ができないと言われてしまい、困っております。
解消する為には高額な開発費用が必要になるとの事。

素人考えで恐縮ですが、サーバーの容量等で登録（増加）ができないならわかりますが、商品の差し替えや削除ができないというのは理解出来かねております。

原因を把握して対処したいのですが、そもそも何を把握しすればよいか（何を聞けばよいか）わかりません。

ご教示お願いできますでしょうか。