> バージョンですが最初の投稿の下部に書いていたのですが
下記になります。

大変申し訳ございません。すっかり失念しておりました。


reduceStockを下記のように書き換えたらいかがでしょうか？
これで商品ごとに在庫が減るようになると思います。

しかし、下記のコードでniwi様の仕様を満たしたかどうかはわかりませんので、あらかじめご了承ください。

function reduceStock($productClassId, $quantity) {

if ($quantity == 0) {
return false;
}

$objQuery =& SC_Query_Ex::getSingletonInstance();
$arrRet = $objQuery->select('classcategory_id2, product_id','dtb_products_class',
'product_class_id=?',array($productClassId));
if (empty($arrRet)) {
return false;
}

$objQuery =& SC_Query_Ex::getSingletonInstance();
$objQuery->update('dtb_products_class', array(),
'classcategory_id2 = ? AND product_id = ? ', array($arrRet[0]['classcategory_id2'], $arrRet[0]['product_id']),
array('stock' => 'stock - ?'), array($quantity));

$productsClass = $this->getDetailAndProductsClass($productClassId);
if ($productsClass['stock_unlimited'] != '1' && $productsClass['stock'] < 0) {
return false;
}

return true;
}