お世話になります。
eccube-2.13.1のインストール時にDB情報を入力する画面で以下のようなエラーになりました。

※インストールの前に新しくDBを作成しておく必要があります。
>> MDB2 Error: not found
[Error message: extension mysql is not compiled into PHP]

MDB2は、pear listで表示すると入っていて、
MDB2 2.4.1 stable
がインストールされています。
mysqlへのログインは端末では通常の操作が可能ですが、どうやらEC-CUBEからのみ接続が不能になっているようです。現在PHP5.4を利用しているのでが、ひょっとしてphpのバージョンが関係しているのかなとも思いました。
ここら辺りで何かしら情報や解決方法お分かりの方、ご教授お願いできますでしょうか。よろしくお願いいたします。
OSはcentos6.3です。