sumida様、seiyawada様、
ご教授頂きまして感謝致します。ご教授を基に、また過去の投稿(条件分岐の式自体は正しい)を参考に以下の記述を試したところ、Wrong datatype〜のエラーは出なくなりましたが、記述の組み合わせが認識されていない様でございまして、X;が読まれません。（Xがないというエラーがログファイルにでます。条件式なしでX;だけ配置しますと機能します。）

何かアドバイス等を頂けませんでしょうか。

function getNewProducts($limit, $period) {

$arrGetConditions['prefecture_number'] = $this->getConditions($limit, $period);

$check = array(1);
$flag = false;
foreach($check as $val){
if(in_array($val,$arrGetConditions['prefecture_number'])){
$flag = true;
}
}
if($flag === true){
X;
}

$check = array(2);
・・・
}
******************************************
var_dumpを以下の様に試したところ、

$arrGetConditions['prefecture_number'] = $this->getConditions($limit, $period);
var_dump($arrGetConditions['prefecture_number']);

以下の様に["prefecture_number"]=> string(1) "1"は抽出されているようでございます。

var_dumpの結果
array(6) { [0]=> array(151) { ["product_id"]=> string(3) "131" ["prefecture_number"]=> string(1) "1" ["category_id"]=> string(2) "42"
・ ・・

また"2""3""4""5"とvar_dumpに抽出された新着商品全てのprefecture_numberに上記の$check = array(X);で条件設定して試しました。

Getcolではdumpした際にnullとなり何も抽出しないようです。元々selectで新着商品を抽出しておりました。
$arrvalは書き忘れただけでして設定しておりました。