はじめて投稿させていただきます。
こちらのサイトにも利用可能なレンタルサーバーとしてご紹介のあった、Fサーバーにてeccube-1.4.5を利用させていただきショッピングサイトの立ち上げ準備をしている者です。（スクリプト全般あまり詳しくありません）
この度FサーバーがPHP5「CGI版」に切り替える旨のメールが来まして愕然としております。
現PHP4「DSO版」は３月に廃止する予定のようです。（存続を要望しましたが無理のようです）

＜変更点＞

PHP4（従来）→　PHP5
提供形態：DSO版　→　CGI 版
PHPプログラムへのパス記述：不要　→　必要
ファイルのパーミッション：644　→　755　※アップロード後に変更が必要
プログラムの拡張子：.php　→　.php5
改行コード　→　「LF」　※「CR+LF」などではエラーとなります

そこで教えていただければ有難いのですが、

1.上記を変更したとして動作に支障はないでしょうか？（ファイル内のパスの記述のファイル名も変更したとしてです。）

2.実際に直すファイルは「カスタマイズ/ディレクトリ構成」に記載のファイルでよろしいでしょうか？

その他、注意点、アドバイスなどございましたら、ご教授いただけましたら大変有り難くよろしくお願いいたします。