プラグイン開発担当に確認致しましたところ、現在は当該箇所の編集はできません。
※EC-CUBEの2系と3系の間の仕様の相違により、支払方法として登録する際には問題ございませんが、登録内容の利用条件の編集・更新を行うことができない状況でございます。

また、手数料欄につきましては、クレジット決済の場合、カード会社がカード決済の手数料をエンドユーザ様に請求することを禁止しているため、手数料を設定できなくしております。