大河内です。

エラーの内容を見るかぎりは、EC-CUBE の不具合ではなさそうですね。

EC-CUBE のプログラム自体は、正常にログインのエラーを処理し、PHP がエラーメッセージを出力しようとしている時に Zend API がエラーを出しているようです。

該当のエラーを出力している zend_compile.c のコードをざっと眺めてみましたが、PHP がプレコンパイルの失敗等で、関数をロードできない場合に、このようなエラーになるようです。

このエラーは、 version1.0.1 を使用した場合に、該当箇所で毎回出力されますか？

また、PHP は、どのようにインストールされましたか？
もう少しよく調べないと、正確な原因は解りませんが、PHP をインストールしなおしてみると良いかもしれません。

# 最新版である、 PHP4.4.4 をインストールすることをおすすめします。

できれば、 rpm 等のバイナリを使わずに、 ソースをビルドし、 make した後に、 make test を実行して、実行結果を確認した方が良いと思います。