ファイルを保存する時に、「UTF-8」で保存していますか？

あと、一括登録した時はこれまでのパスワードは利用できないために、あらかじめ管理者側で仮パスワードを設定する必要があります。
私の場合は、最初「あいうえお」の仮パスワードで手動で登録して、暗号化されたパスワードを一括登録する時に、全てのユーザーにコピペで設定しました。

一括登録が済んでから、メルマガ機能で仮パスワードのお知らせと、パスワードの再設定のお願いを送信しました。

確かに一括登録の機能があると便利ですが、一括登録する機能があっても利用するのは、他のカートシステムから移行した場合の最初だけだと思いますので、特に一括登録の機能追加はしていないのだと思います。

２０００件を１つ１つ登録するのはかなり大変だと思いますので、一括登録をもう少し試してみても良いかもしれませんね。