> seasoft様のいう設定した状態とは、my.cnfの設定でよかったでしょうか。

たしかそうだったと思います。
また、初期化のオプションでも設定できたと思います。


> また初期化するとは具体的に一体どのようにするのでしょうか？

http://dev.mysql.com/doc/refman/5.1/ja/drop-database.html
http://dev.mysql.com/doc/refman/5.1/ja/create-database.html


> 初期化の際に消えてしまうのは、DBの中の情報だけでしょうか？

DB を初期化した場合は、そうだと思います。

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Seasoft
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