有難うございますm(__)m

html以下にdataフォルダを入れる前は正常に稼動していたということでしょうか？

はい。動いていました。
先程の質問に少し語弊がありました。すみません。
html以下にdataに既にフォルダは存在しておりました。そのフォルダは開発者が置いていたのでそのままにしておりました。（まず使われていない）
eccube/以下のdataフォルダをhtml以下のdataフォルダにコピペすればOKだと思い、単純に入れてしまいました。
それからこのような状況になりました。