// installページへのURLを生成。 
$location = realpath('/' . $url_dir . '/install/index.php');

header('Location: ' . $location);

のrealpath()はまずいと思います。

UNIX系は試しておりませんが、Windows系では

C:\foo\bar\eccube\html\install\index.php

になってしまうようです。

あと贅沢をいうと、DATA_DIR2HTMLは定義されていても、実際には未使用だったと思います。
そのまま未使用で済ませられるのでしたらありがたいのですが...

ご確認願えますでしょうか。