seasoft様、アドバイスありがとうございます。

無事に解決する事ができました(^-^)
ご回答を頂いた通り、いくつかのチェンジセットを適応する必要がありそう。
検索で下記のサイトを参照致しました。
【EC- CUBE】“商品ごと”や“重量別”など送料カスタマイズ

今後他のユーザーさんの参考になるように、こちらに導入方法を記載しておきます。

下記のチェンジセットを順番に適応。
チェンジセット 17970
チェンジセット 17971
チェンジセット 18114

そして最後に、下記を適応。
都道府県・重量別送料


正式版を利用のユーザーさんの場合は、上記の適応で都道府県や重量別で送料のカスタマイズができるようになります。
管理画面の送料無料設定をしている場合は、重量に関わらず送料無料の金額の条件を満たした場合、送料が０円になってしまいます。
送料無料条件を空欄に設定しておけば、都道府県や重量別の送料で計算されます。

私の場合は、以前に解決済みの商品コードでの送料カスタマイズも一緒に利用する事で、同梱不可能商品の送料もまとめて計算できるようにしております。


同梱不可能商品なども１度の注文処理でまとめて送料計算もしたい場合は、上記の商品コードでの送料カスタマイズを利用すれば対応できると思います。

あとは必要に応じて『都道府県・重量別送料』や『重量で送料を加算』を適応してあげれば、かなり幅広い送料設定のバリエーションができると思います。


今後、他のユーザーさんの参考になれば幸いです。