> ブラウザでリンクを直打ちすると画面に404エラーが出力されます

それが原因かと。
エラー文言とも整合しています。


> ファイルは存在し中身もちゃんと書かれています

仮に「ファイルは存在し中身もちゃんと書かれています」が正しいとしたら、中身(処理)が誤っている事になります。

中身を <?php echo'OK'; ?> など、単純なものに書き換えて動作確認することで、ファイル配置などの問題か、中身の問題かを強化することができると思います。(動作すれば後者、しなければ前者の問題と推測できます。)


> パーミッションも問題ないと思います

根拠が示されていないので、あくまでも勝手な推測の域ですが、怪しい気はします。

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Seasoft
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