＞データベースを移してから、「データベースを初期化しない」にチェックをいれてインストールしないといけなかったってことですか＞＜

一つの手段として、いっただけです(゜o゜)
やり方なんて色々ありますよ。

開発環境と運用環境は、
.htaccessで入れないとか、移行する際ファイルアクセス権限変わちゃって入れないだとか、暗号化方式違っててとか・・・
色々ケースはありますから、再インストールなら一通りチェックもしてくれるので、楽なだけです。
まぁ開発時にいらないファイル削除なんかしてると、再インストールすると復活しちゃうなんてこともありますので、注意は必要ですけどね。