１系から２系へ会員情報を移行する際に、パスワードがうまく移行できません。

PASSWORD_HASH_ALGOSとAUTH_MAGICを合わせれば行けると思うのですが、1.4.6の設定地がわかりません。

どなたか教えて頂けないでしょうか？

sha1(”パスワード文字列” . ":" . AUTH_MAGIC);

で, マッチする文字列を取得できると思います.
1.4.6 では PASSWORD_HASH_ALGOS は使用しません.

2系とは2.4系ですか？それとも2.11以降（2.12を含む）でしょうか。

2.4系ならば1系でデフォルト値で運用していればそのままDBの情報をインポートすればよさそうですが。2.11以後からセキュリティ上仕様が変わったのでパスワード移行は困難だと思います（たぶん。

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define('AUTH_MAGIC','xxxxxxxx');
↑AUTH_MAGICを１系の値と同じにする「data/conf/core.php」

define('PASSWORD_HASH_ALGOS', 'sha1');
↑セキュリティの問題は目をつぶって「sha1」に戻す

この設定でうまく移行できた様です。