kagoyaの専用サーバに、手動でeccube3.0.12をインストールしているのですが、データベースの初期化のところで、下記の Fatal error が発生します。

Fatal error: Maximum execution time of 30 seconds exceeded in
/home/********/public_html/eccube_test/vendor/doctrine/dbal/lib/Doctrine/DBAL/Schema/AbstractAsset.php
on line 199

テーブルは作成出来ていたので、
2回めのインストールでデータベースを初期化しないようにすると、最後まで完了出来ますが、管理ページにアクセスしようとすると、システムエラーになります。

原因が分かる方、教えていただけますと助かります。よろしくお願いします。

データベースの構築が全て完了していないのではないかと思います。
PHPの実行時間の制限(30秒)に引っかかっているようですので、
PHP.iniのmax_execution_timeを変更して、制限時間を伸ばして、
再度、インストールしてみては如何でしょうか？
（初期化は必要かと思います。勿論、運用はまだですよね？）

インストールのDB構築時にそのエラーが出た事が無い為、直接の原因はわかりませんが、
実行時間を伸ばしても同じエラーが出るのであれば、DBなどサーバ環境の問題かと思います。