▼テンプレート
[EC-CUBE] 3.0.14
[OS] Linux jp14.zpool.jp 3.10.0-514.26.2.el7.x86_64 #1 SMP Tue Jul 4 15:04:05 UTC 2017 x86_64
[PHP] 5.6.33 (Core, date, ereg, libxml, openssl, pcre, zlib, filter, hash, pcntl, readline, Reflection, SPL, session, standard, cgi-fcgi, bcmath, calendar, ctype, curl, dom, fileinfo, ftp, gd, iconv, imap, json, mbstring, mcrypt, mysqlnd, mysql, mysqli, PDO, pdo_mysql, pdo_pgsql, pdo_sqlite, pgsql, Phar, posix, SimpleXML, sockets, sqlite3, tokenizer, xml, wddx, xmlreader, xmlwriter, xsl, zip, mhash)
[データベース] MySQL 5.6.38
[ブラウザ] FireFox
[導入プラグインの有無] GMOイプシロン
[現象] 帳票プラグインを追加したく上記対応プラグインを追加するが、赤文字エラーによりサイズが大きすぎる為失敗、独自プラグインとしてアップロードしなおすが、ファイルサイズが大きすぎる為失敗します。既存の投稿も確認し、upload_max_filesizeなども確認しましたが、９９９Mに設定している為、アップロードサイズは上限を満たしておりません。.htacessは以前ドメインの関係で一度削除しており、PHP.iniの場所は、システム情報で確認しディレクトリは把握しておりますがどこに属するのかが不明です。（/opt/cpanel/ea-php56/root/etc )そこまでリテラシーが無く初のオープンソースになりますので、どなたかご教授ください<(_ _)>

＞upload_max_filesizeなども確認しましたが、９９９Mに設定している為

管理画面の設定＞システム設定情報＞システム情報の画面にて、
実際にPHPの設定値(upload_max_filesize等)が設定した値になっているか確認したほうが良いかもしれません。
php.iniを変更した際、Apacheの再起動忘れで設定値が変わっていない可能性も考えられますので。

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株式会社シロハチ
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ご返信ありがとうございます。

こちらシステム情報から確認し９９９Mになっております。
PHPiniのディレクトリの所在にたどり着く方法がわからないのですが、ご教授いただければ幸いです。※ディレクトリは質問板にあります。

連続して送信失礼します。

本件、解決しました！
お力添えいただきありがとうございます。

・PHP上限は記載の通り問題ございませんでした。

原因としては、
オーナーズストアの認証キーが外注した決済モジュールの認証キーと相違した新規の認証キーになっていた為、新規認証キーにて既存の決裁モジュールを再インストールし、１つの認証キーに整理することで無事反映されました。

PS：エラー内容がサイズオーバーでしたが、精密には認証キーが相違していると出てくればわかりやすい！なと思います。