確認です。

出荷データCSVから伝票番号を登録した際の挙動（自動）として、

●注文者に出荷メールを送信
●ステータスが出荷済みに変更（既に出荷済みのデータに対してはエラー）

の認識で良いでしょうか？

バージョンは4系でしょうか？
出荷CSVで伝票番号を登録した場合、メールは送信されない気がします。

他にカスタマイズしていなければ出荷済にステータスが変更されるのでポイントの付与は行われるかと思います。

失礼しました。Ver.4になります。

実際に確認を行い、出荷メールは送信されない事を確認しました。

ありがとうございました。