ECサイトのバックアップを定期的にとりたいと思っているのですが、どの方法が一番いいですか？
バックアップの頻度／月１もしくは週１くらい？
バックアップの対象／ファイル（全て）・データベース（顧客情報／商品情報／決済情報）
サイトの概要／ECサイト

簡単にですが、調べたところ３通りあると思っているのですが、合っていますか？
１.契約しているレンタルサーバーでバックアップをとる
2.phpmyadminでデータベースをエクスポートし、ファイルはFilezillaでファイルをダウンロードする
3.EC-CUBEの管理者画面でシステム設定からバックアップとる

この３つで１と３の場合、全てのバックアップを取れるのかなども疑問です。
またどの方法でも決済情報の履歴などは取得できないですか？

[EC-CUBE]　2.13.3
[レンタルサーバ]　CPI
[PHP]　5.5.23
[データベース]　　MySQL 5.5.42
[WEBサーバ] Apache
[ブラウザ] 使用しているブラウザ名、バージョン
［決済］ GMO提供のプラグイン（GMO ペイメントゲートウェイ）
[導入プラグインの有無] 有
[カスタマイズの有無] 有

サーバー上でバックアップを取るような処理を入れる方がいいとは思います。

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http://ec-lab.net/

レンタルサーバーでは難しいでしょうが、クラウドのサーバーなら毎日サーバーのディスクやDBのバックアップを自動で保存できるのでそういう運用にしてるところは多いかと思います。