EC-CUBEアップデートプラグイン(4.0.3〜4.0.4) のインストールをしましたが、アップデートされていない

[EC-CUBE] 4.0.4へのアップデート
[レンタルサーバ] さくらインターネット
[OS] FreeBSD www672.sakura.ne.jp 11.2-RELEASE-p14 FreeBSD 11.2-RELEASE-p14 #0: Mon Aug 19 22:38:50 UTC 2019 root@amd64-builder.daemonology.net:/usr/obj/usr/src/sys/GENERIC amd64
[PHP] 7.3.22 (モジュールモード)
[データベース] MySQL 5.7.32-log
[WEBサーバ] Apache
[ブラウザ] GoogleChrome若しくはFireFox
[導入プラグインの有無]
　・全ページ対応パンくずリスト表示プラグ（2.0.0）
　・最近チェックした商品（1.0.1）
　・送料無料対象商品設定プラグイン（1.1.1）
　・配送方法設定拡張プラグイン（1.1.0）
　・メーカー管理プラグイン（4.0.1）
　・ペイパルチェックアウト決済プラグイン（1.0.5）
　・商品レビュー管理プラグイン（4.0.1）
　・おすすめ商品管理プラグイン（4.0.0）
　・関連商品プラグイン（4.0.1）
　・帳票PDFプラグイン（4.0.1）
　・売上集計プラグイン（4.0.1）
　・商品並び替えプラグイン（1.0.3）

[カスタマイズの有無] 特になし
[現象] エラーも何もなく、アップデートが完了しました。
と出ましたが、【設定→システム設定→システム情報】を開くとEC-CUBE4.0.3　となっており、アップデートがうまくいっていない？状況となっています。