[EC-CUBE] 4.0.3
[レンタルサーバ] Xserver
[OS] 使用しているOS名、バージョン
[PHP] PHP7.2.34
[データベース] 使用しているDB名、バージョン
[WEBサーバ] 使用しているWEBサーバ名、バージョン
[ブラウザ] 使用しているブラウザ名、バージョン
[導入プラグインの有無] あれば導入プラグインを記載
[カスタマイズの有無] あればカスタマイズ内容を記載(できるだけ具体的に)
[現象]

<前提>
商品はすべて10%のものを扱っており、設定も10%です。商品個別の税率設定はしていません。

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例えば、税抜10,000円で商品規格を登録した商品があり、購入があった際、通常であれば10,000円(税抜)→税1,000円→小計11,000円という表示(扱い)になるはずですが、受注詳細から商品情報を見ると、10,000円(税込)→小計10,000円っという扱いになっており、税抜・税込が正しく機能しない時があります。

そのエラーが原因か分かりませんが、納品書を出力してもエラー商品だけは明細に載りません。

しかし、試しにエラーの起きた商品を別の注文として買ってみると今度は10,000円(税抜)→小計11,000円という正常な状態になり、納品書にもきちんと掲載されます。


どのような条件が重なればそうなるのかが不明なエラーが出ており、どなたかご教示いただけませんでしょうか？

引用：

発生手順が不明なので、どの様な条件が重なればエラーになるのか不明です。
導入しているEC-CUBE4.0.3との事なので調べてみましたが、下記のEC-CUBE4.0.4のリリース情報にある「商品別税率機能が適応されない場合がある不具合の修正」にあたるない様なのではないでしょうか？
https://www.ec-cube.net/news/detail.php?news_id=356