これはバグと呼べるかなと思うため、報告させてもらいます。
環境は、
EC-CUBEバージョン 2.3.0
PHPバージョン 5.2.6
PostgreSQL 8.3.4
ブラウザ IE6、Firefox3、Opera9 （Windows）

発生手順
(1) 管理者画面の「基本情報管理」の「配送設定」画面を開く
(2) デフォルトで「サンプル業者」が登録されていますが、それの「変更」ボタンを押す
(3) 変更画面では何もせずに、「ブラウザの戻る」で戻る。
（下にある「前のページに戻る」ボタンでは症状は発生しません）
(4) 戻ったら、「配送業者・配送料を追加」ボタンを押す。
(5) すると、先ほどのサンプル業者がデフォルトで入ってしまっている。
（本来全て空白のはず）
(6) データを編集後「この内容で登録する」を押すと、登録済みのサンプル業者が
更新されてしまう。
（本来、新規追加のはず）

ブラウザの戻るを使わなければ起きない症状のため、
ブラウザの戻るは使うな、といえばそれまでですが、
普通の人は使ってしまうと思います。

私の見解では、最初に変更ボタンを押した際に、
JavaScriptで、「deliv_id', 1」が設定されていて、
ブラウザの戻るで戻っても、それがセットされたまま保持されているため、
この症状が起きているのかと思います。

よろしくお願いします。