ありがとうございます。
常にSSL設定にして接続設定を確認してみます。

通常、クレジット決済などの仕組みはSSL環境の利用が前提かと思います。
httpとhttpsの混同についてですが、サイトを常にhttpsにはされていない状況ですか？
httpから始まるURLとhttpsから始まるURLは、セッションが共有されない事はありますが、
それが原因であればサイト全体をhttpsにすれば解決すると思います。

受注処理の最後にカートの中身をクリアする処理がありますが、
その手前で何かしらのエラーが発生して処理が正常に完了していないのではないでしょうか？
正常な状態であれば、
/src/Eccube/Controller/ShoppingController.php function confirm()内の

が処理されるはずです。

ただ、プラグインの作り方によっては、ここを通過しない可能性もありますので、
ソースを読んで、実際の流れを一つ一つ確認するのが確実かと思います。

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イプシロンに問い合わせましたが以下の回答でした・・・。

対象取引について、決済が正常完了していることを確認いたしました。

【イプシロンの返答】
「決済完了後にカートが空にならない場合は
データ連携においてhttpとhttpsが混同し
情報の連携がうまく出来ていない可能性がございます。

そのため、まずは貴社システムのログなどから
httpとhttpsが混同していないかご確認いただけますでしょうか。

なお、上記にご案内している確認事項につきましては
弊社環境外での確認となりますので
確認方法などのご案内はいたしかねますことあらかじめご了承ください。」

確認方法は聞くなとのことです。
イプシロンはsslに対応していないのでしょうか？

ご返信ありがとうございます。
コンビニ決済を追加して購入完了まで進んだらカゴの中がリセットされました！
イプシロン側のエラーかと思われますのでイプシロンに問い合わせてみます。

ありがとうございました！

通常は購入完了画面が表示された時点で、カートの中身は空になります。
（購入完了処理の際、セッションをクリアする処理があると思います）

クレジット以外の支払方法の時は正常にクリアされますか？
もし、クレジット以外の支払方法でもクリアされない場合は、イプシロン決済プラグイン以外の箇所に問題があると思います。

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[EC-CUBE]3.0.15
[レンタルサーバ]zenlogic
[ブラウザ]chrome
[カスタマイズの有無]フロントを編集済み
[現象]
度々申し訳ありません。
聞ける人がいないのでどうかよろしくお願いいたします。

購入完了画面になっても先ほど買った商品がカゴに入ったままです。
これは購入が完了したら一旦、空になるものではないのですか？
管理画面からでも入金済みとしてクレカ決済が完了しています。

イプシロンの決済プラグインなのですが使用でしょうか？