DNSの設定でSPFレコードは設定されていますか？
ECCUBEではなくDNSの話になるので詳細は別途調べていただきたいのですが
送信元のメールサーバが正当なものか判断するのに利用される情報ですので
SPFレコードが正しく設定できていないと受信側のセキュリティの仕組みで勝手にメールが破棄される場合があります。
その場合は相手にはまったくメールが届きませんし、こちらにもエラーメールは返ってきません。
gmail等はドメイン名の逆引き設定なども設定していないとメールが破棄される事がありますのでドメイン周りの設定を確認してみてください。
レンタルサーバのメールサーバを利用している場合は、SPFレコードの設定は正しく行われていると思いますが念の為。

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ご回答ありがとうございます。

確かに、迷惑メールで気付かなかった顧客もいました。

しかしながら、迷惑メールにも届いていないという回答が３割ほどあります。

再送した際は問題なく届くので、自動メールと再送メールで何か違う点があるのかと疑問に思っております。

何かお気づきの点がありましたらよろしくお願いします。

引用：

＞・自分宛てにも同時に送っているのですが、そちらは届いています。
毎回ご自身に届いているという事はメールは正常に送信されていると思います。
お客様へ届いた際、迷惑フォルダに割り振られているのを見落とされているという事は可能性としてないでしょうか？

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[EC-CUBE]EC-CUBE 3.0.17
[レンタルサーバ] Xserver
[OS] Linux sv8302.xserver.jp 4.4.0-169
[PHP] 7.1.33
[データベース] MySQL 5.7.27
[WEBサーバ] Apache
[ブラウザ] Chrome

[現象]
お世話になります。

仮会員登録をした方に本会員登録リンクを記載したメールが届かない現象が多発して困っています。

docomoなどのキャリアメール、Gmail などのフリーメールそれぞれで発生しており、原因が分からない状態です。

・自分宛てにも同時に送っているのですが、そちらは届いています。
・お客様から届いていないと連絡があった場合は、再送信しており、そちらは問題なく届きます。（特に設定なども変更頂いていません。


現在は、連絡があったお客様に個別で対応したり、定期的に仮会員情報を削除して再び会員登録を出来るようにしています。

限られた情報しかありませんが、
解決に向けて皆様のお知恵をお借りできれば幸いです。