Command経由で実行する際に、トランザクションにロックがかかっているためそのようなエラーが出ていると思います。
どこかでflush()し忘れている箇所などないでしょうか？
もしくは、下記などを参考にし、lockModeを指定することで解決できるかもしれません。

https://stackoverflow.com/questions/22592582/using-find-from-repository-throwing-a-transactionrequiredexception

Command経由で注文ステータス変更

決済処理中 or 購入処理中 → キャンセル

$this->orderStateMachine->apply($Order, キャンセル)



管理画面からは、問題なく「決済処理中 or 購入処理中 → キャンセル」可能
Command経由からはエラーが出る

調査中ですが、解決できる情報がなく困っています。
ご協力よろしくお願いいたします。