引用：
参考にさせていただきます。
色々と親切にありがとうございました。
大変助かりました。

GmailやYahooメールなどは、無料でアドレスを作る事が出来るので
作成して、EC-CUBE（システム側）のメール送信ログを取ったりしつつ、サーバ側の確認するしかないのではと思います。
https://qiita.com/nanasess/items/c80f4eb2dd9390b8e510

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引用：

DNSレコード設定を確認したところ、対象ドメインに「v=spf1 …」との登録がありましたので、設定済みかと思います。

1500通以上のメールを送信していないのとxserverに送信履歴がないと回答をいただいているため、制限には掛かっていないかと思います。

別サーバにて運用しているのであれば、ドメインのDNS登録をSPFレコードの設定をしていますか？
xserverサーバをご使用であれば、メール送信件数の制限に掛かっている事はありませんか？
https://www.xserver.ne.jp/manual/man_mail_spec.php

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引用：
メールサーバは別サーバ（xserver）で運用しております。
わかりにくく申し訳ございません。

> SMTP設定はされており、大多数の注文者にはメール送信されますが、一部注文者にメール送信されないことがあります。
> メール送信元のメールサーバー（xserver）に問い合わせたところ、該当注文者への送信履歴はないとの回答でした。

本スレッドの最初の投稿で、ご使用のサーバはさくらクラウドとありましたが、メールサーバは別サーバ（xserver）で運用している状態ですか？

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引用：
SMTP設定はされており、大多数の注文者にはメール送信されますが、一部注文者にメール送信されないことがあります。
メール送信元のメールサーバー（xserver）に問い合わせたところ、該当注文者への送信履歴はないとの回答でした。

> ファイルを確認したところ、既に設定されておりました。
設定されており、問題なくメール送信されているという事ですか？

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ありがとうございます。
ファイルを確認したところ、既に設定されておりました。

引用：
上のトエビス株式会社さんが紹介しているURLは、EC-CUBE4系の説明です。
tateさんの環境であるEC-CUBE3系ですと下記の設定ファイルになります。
app/config/eccube/mail.ymlにメール設定がありますので、そちらを参照してください。
さくらインターネットですと、下記の様な設定内容になるかと思います。
XXXXは、実際の送信元にするメール設定に合わせて設定してください。
引用：

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