他のサーバで正常に動作したということでしたら、
ヘテムルのサーバのApacheにmod_headersの
モジュールがはいっていない可能性が高いですが、
phpinfo()などで情報を確認してみてはいかがでしょうか。

管理画面はそのままで使用できるようにし、トップページのみ非表示にしたいです。しかもIP制限ができるようにしたいです。

現在、設置しているディレクトリは一番最初のディレクトリに「html」の中のデータをアップロードし、その中に「date」をフォルダごとアップロードしています。※「define.php」の中身もそれにあわせて変更しています。

この状態で、以下のサイトの「しっかりバージョン」を実行してみても、「500 error」になります。
http://web-tan.forum.impressrd.jp/e/2009/06/16/5880

何か属性など間違っているのでしょうか？

これはヘテムルなのですが、ロリポのサーバーで実行した際には、正常に動作しました。何が原因でしょうか。