お世話になっております。

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■環境

・ECCUBE　2.13.3

・プラグイン　
　-カテゴリ別MV枠追加 2.13版 1.0
　-クロネコヤマト　カード・後払い一体型決済コア機能プラグイン 1.0
　-クロネコヤマト　カード・後払い一体型決済補助機能プラグイン 1.0
　-のし対応 1.3.5
　-配送先別 商品別 CSV ダウンロード 1.4
　-UA版 Google Analytics eコマース対応 プラグイン 1.4

・モジュール
　-クロネコヤマト カード・後払い一体型決済モジュール(2.13系)

・PHPバージョン PHP 5.3.3
・DBバージョン MySQL 5.1.73-log
・サーバー　Wadax　共用サーバ　シルバー
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表題の件、先日までは正常に動作していたのですが、ある時から文字化けしたCSVがダウンロードされるようになりました。
どうやらUTF-8でダウンロードされているようです。

配送先別 商品別 CSV ダウンロード 1.4でダウンロードされるCSVも同様でした。
上記プラグインで現れる「B2 CSVダウンロード」ボタンからのCSVや、「高度な設定」＞「CSV出力設定」でのCSVは化けていません。

eccubeのエラーログには下記のような表示がありました。

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（このエラーログはこの減少が起きるよりも前から継続的に出ているものです）
2017/01/10 09:29:29 /[パス]/html/admin/order/index.php Warning(E_USER_WARNING): 前方互換用メソッドが使用されました。 on [/[パス]/data/class/helper/SC_Helper_CSV.php(320)] from **.***.***.**
2017/01/10 09:29:29 /[パス]/html/admin/order/index.php Warning(E_USER_WARNING): 前方互換用メソッドが使用されました。 on [/[パス]/data/class/helper/SC_Helper_CSV.php(281)] from **.***.***.**
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（このエラーログは上のように継続的に出ているものではありませんが、この現象が起きる前にもでています）
2016/12/16 10:39:58 /[パス]/html/admin/system/editdb.php Warning(E_WARNING): array_search() expects parameter 2 to be array, object given on [/[パス]/data/class/pages/admin/system/LC_Page_Admin_System_Editdb.php(201)] from **.***.**.***
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サーバのエラーログには特にそれらしきエラーはありませんでした。

このエラーが出る前に、下記ファイルを一部編集しました。
data/class_extends/helper_extends/SC_Helper_Purchase_Ex.php
長期休暇に備えて、発送目安の$start_dayを全て''にしていたのを、元の通り数値を入力しました。
しかしながら、この編集は今まで何度も行っており、今まではこのような現象は出ておりませんでしたので、直接の関連性はあまりないかもしれないと思っております。

「mb_convert_encoding」を文字列として含むファイルは触っておりません。

なにか特定の注文が影響を及ぼしているのかもしれないと思いましたが、エラーが出る以前のCSVをダウンロードしても同様でした。

何が原因か、ご教授いただければ幸いです。

以上、よろしくお願い致します。