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[EC-CUBE] 4.0.5、アップデート
[レンタルサーバ] エックスサーバー
[OS] Linux sv5291.xserver.jp 4.4.0-211-generic #243-Ubuntu SMP Thu Apr 29 09:14:13 UTC 2021 x86_64
[PHP] 7.4.25
[データベース] MySQL 5.7.27
[WEBサーバ] 不明
[ブラウザ] Firefox 94.0.1
[導入プラグインの有無] ゼウス決済プラグイン、XSS脆弱性修正プラグイン、おすすめ商品管理プラグイン、商品並び替えプラグイン
[カスタマイズの有無] 前担当が行ったため不明
[現象]
4.0.1からプラグインで順次アップデートを行っていましたが4.0.5にアップデート中にエラーが発生しました。
手動で4.0.5に上書きを行いましたがエラーは解消せず、ディレクトリを削除してバックアップデータで4.0.1に戻し4.0.5まで手動でアップデートしたところEC CEBEが稼働しました。
ただ、すべてのプラグインが稼働しなくなってしまい、どうしても必要なゼウス決済プラグインだけ管理画面から削除→バックアップから再インストールを行いました。
しかし、ゼウス決済プラグインを有効化すると管理画面の[受注管理]>[受注一覧]と[受注登録]がエラーで表示されなくなります。
ショップ画面でもレジへ進もうとするとエラーが起きてしまいます。
プラグインを停止すると問題なく表示されますが、決済プラグインが動かないので決済ができません。
プラグイン制作会社に問い合わせましたが再現性がないとのことで、こちらで相談させていただきました。

・プラグインが管理画面から有効化/無効化/削除できない。(なぜかゼウス決済プラグインだけ削除に成功したが、2回目以降の削除はほかのプラグイン同様に完了したと表示されるが削除されず)
・おすすめ商品管理プラグインは無効になっているが管理メニューには項目があり以前登録したデータがある。(おすすめブロックが壊れているため動いているかチェックできませんが、新規追加や並び替えは問題なくできます)
・コマンドでプラグインを削除等をしようとすると許可がありませんと表示されて作業できません。(FTPからサーバにアクセスすることは可能です)

難しいと思いますが、どなたかご助言よろしくお願いします。