EC-CUBE 4.0.5
PHP 7.4.21
商品CSV登録拡張プラグイン 1.0.5
商品項目追加プラグイン 1.0.3

商品CSV登録(拡張)で次の INFO ログが大量に発生してしまい、メモリーリークが原因と思われる 504　Timeout が発生してしまいます。
200件の商品を更新しようとすると10万件ほど出力されます。
User Deprecated: Calling Doctrine\ORM\EntityManager::flush() with any arguments to flush specific entities is deprecated and will not be supported in Doctrine ORM 3.0.

ログによると次の箇所で発生しているようです。
解決方法わかりますでしょうか？
app/Plugin/ProductPlus/Repository/ProductDataRepository.php


なお、単純に flush の引数を削除しただけだと別のエラーになってしまうようです。
（出力したCSVを加工せずそのまま登録しているだけなので、 DELETE が走るのはおかしいですが、これもメモリーリークのせいでしょうか。）
An exception occurred while executing 'DELETE FROM dtb_product_class WHERE id = ?' with params [23]:
SQLSTATE[23000]: Integrity constraint violation: 1451 Cannot delete or update a parent row: a foreign key constraint fails