横から失礼します。
今までThunderbirdでメール受信していたので気づかなかったのですが、Outlookで受信してみたら、私も改行なしの状態になりました。
（ちなみにThunderbirdで受信すると改行がすべて2個になってしまう状態で、そのうち直さなければ・・・とは思っていたのですが）

以前、メール送信時の改行の扱いで困ったことがあって、その時に調べた記憶では（うろおぼえのところがありますが）
・Windows、Mac、Unixで改行コードは違う（これは当たりまえ）
・メールサーバ（あるいはサーバ環境？）によっても、改行の扱いが違う
＝＞メール送信時には改行コードを統一して送る

ということで、いつも使っているコードをGC_SendMail.phpのメール送信処理の直前に入れてみました。

$this->body =
str_replace("\r", "\n", str_replace("\r\n", "\n", $this->body));

一応これでOutlookでも改行がある状態で受信できるようになりました（かつ、Thunderbirdでも改行が正しく1個で表示されるようになりました）

ちなみにサーバはXREAです。

XREAのほかにラピッドのサーバもさわっているのですが、こちらは
Thunderbirdでの受信時、改行は1個＝正しく表示されているようです。
※ラピッド＆Outlookでは試してません。気になるのでそのうち試してみようと思います。

メールサーバの挙動に関して私自身の理解が非常にあいまいなので、解釈違いやもっとよい対応などありましたが、ご指導ください。